Kompleks muzium adalah loji kuasa yang dibina semula pada awal abad ke-20, struktur bata dengan hiasan stuko neoklasik, di mana bentuk kristal ciri Libeskind tertanam. Dari luar, mereka membaca seperti keluli tahan karat biru padu dan memanjang yang menonjol dari lantai bangunan. Mereka dalam bentuk dua huruf abjad Ibrani - "topi" dan "iod", yang bersama-sama membentuk moto projek Libeskind L'Chaim, yang berarti "untuk hidup." Namun, mereka hanya dapat dibaca jika anda melihat bangunan dari atas, yang tidak dapat diakses oleh pengunjung muzium rata-rata.
Di lobi muzium, dinding di seberang pintu masuk dilapisi dengan garis lekapan yang menonjol membentuk kata "pardes", yang bermaksud "Taman Eden," dan juga melambangkan empat tahap pemahaman Taurat. Tetapi elemen projek ini juga dirasakan sukar kerana selekoh tajam di ruang lobi.
Di bahagian utama - tingkat pertama kompleks - terdapat juga auditorium (di langit-langit di mana peta Tanah Suci digambarkan secara abstrak), sebuah pusat pendidikan dan galeri. Di tingkat dua terdapat premis pentadbiran, serta ruang pameran dengan nama yang sama yang tertulis di kubus besar huruf "iodin", yang diterangi melalui 36 tingkap poligonal.
Libeskind sendiri menekankan perbezaan antara bangunan di San Francisco dan muzium Yahudi di Dunia Lama: bangunan California tidak mempunyai cap bencana Holocaust, yang semestinya terdapat dalam projek Eropahnya. Meskipun demikian, bahasa seni bina Libeskind tetap sama: garis tajam dan patah yang sebelumnya melambangkan tragedi sejarah kini harus mewakili "pondok-pondok surga" diaspora Yahudi yang berkembang pesat di pantai Pasifik.
