Projek ini bermula pada tahun 2001: pada tahun 1999, penguasaan Terusan Panama dipindahkan dari Amerika Syarikat ke pihak berkuasa Panaman, dan pada masa yang sama timbul persoalan mengenai penggunaan wilayah yang bersebelahan dengan yang baru. Salah satu bahagian - yang sebelumnya diduduki oleh pangkalan udara Amerika - diperuntukkan untuk muzium. Pembinaan dimulakan pada tahun 2006, tetapi hanya pada awal Oktober ini Biomuseo dibuka kepada orang ramai - walaupun belum sepenuhnya: beberapa dewan dan akuarium tidak akan siap sehingga musim sejuk 2016.
Dengan bumbung aluminium yang berwarna-warni, muzium ini akan mengingatkan akan sifat Panama yang bersemangat, bumbung logam pondok tempatan dan struktur bersejarah infrastruktur terusan. Terletak di semenanjung sempit yang menjulur ke teluk, bangunan ini dapat dilihat dari jauh dan dengan sendirinya dapat menawarkan pemandangan panorama bandar dan "mulut" Pasifik dari Terusan Panama.
Tempoh pembinaan muzium, yang dijuluki oleh penduduk tempatan "muzium yang tidak akan pernah siap," dijelaskan, antara lain, oleh kelayakan rendah pembangun tempatan. Konkrit kasar lantai dan dinding harus dituangkan kembali berkali-kali, dan atap dengan toleransi 6 mm juga menghadirkan banyak kesulitan.
Namun, kini muzium ini tidak hanya berjaya dibina, tetapi hampir sepenuhnya dipenuhi dengan pameran "The Bridge of Life", yang dirancang oleh Bruce Mau. Institusi Smithsonian di Washington bertanggungjawab untuk sisi saintifik projek itu, dan Biomuseo menjadi satu-satunya muzium rakan kongsi di luar Amerika Syarikat.
Muzium ini didedikasikan untuk kepelbagaian semula jadi yang menakjubkan dari Isthmus of Panama: dengan luas 75.000 km2, ia adalah rumah bagi lebih banyak spesies burung, mamalia, reptilia dan tumbuhan daripada gabungan Amerika Syarikat dan Kanada. Di samping itu, eksposisi memberitahu secara terperinci mengenai proses pembentukan isthmus, yang bermula 12 juta tahun yang lalu dan berakhir 3 juta tahun yang lalu. Penampilannya mengubah ekosistem dan iklim dalam skala planet: bukannya lautan tunggal, Atlantik dan Pasifik yang sangat berbeza muncul, Aliran Teluk "bermula" dari Laut Caribbean yang muncul, dan Amerika Utara dan Selatan bersatu untuk pertama kalinya dalam 70 juta tahun. Penghijrahan haiwan yang aktif bermula di sepanjang isthmus, dan baru-baru ini, 15,000 tahun yang lalu, orang pertama melewati laluan ini dari utara ke selatan.
Biomuseo, yang berharga $ 95 juta (tidak termasuk kos ruang pameran yang belum selesai), dirancang terutamanya untuk pelajar sekolah (ia dirancang untuk membawa 40,000 pelajar setahun ke sana untuk lawatan percuma) dan untuk pelancong, kerana terminal kapal pelayaran adalah sangat rapat. Sebaik-baiknya, pihak berkuasa mengharapkan "kesan Bilbao" dari muzium. Menurut rancangan mereka, ia harus menjadi simbol yang sama dengan kota Panama dan negara Panama, yang menjadi Rumah Opera Utson untuk Sydney dan Australia.
